يطور المركز الوطني لليقظة الصحية الحيوانية علاقات مؤسسية مع نظرائه بالخارج من خلال اتفاقيات ثنائية وفي إطار التعاون بين دول الجنوب والشمال وبين دول الجنوب في ما بينها.
- ذكرة تفاهم بين المركز والكالة الوطنية للسلامة الصحية للغذاء والبيئة والعمل
- التوأمة بين فرنسا وإيطاليا وتونس
- اتفاقية بين المركز و معهد ابروز و موليز بايطاليا
- اتفاقية بين المركز ومركز التعاون الدولي في البحوث الزراعية من أجل التنمية
- اتفاقية بين المركز ونظيره المالى المركز الوطني لدعم للصحة الحيوانية
